限制酶點位核酸定序服務（RAD-seq，Restriction-site Associated DNA Sequencing），以限制酶簡化基因體資訊，提升有效數據比例，可同時處理大量族群樣本，降低研究負擔。RAD-seq 可應用於無參考序列之目標物種的族群遺傳變異、定義個體間遺傳差異、族群親緣地理關係追溯等生物演化研究；同時適用於單核苷酸多態性（SNP，Single Nucleotide Polymorphism）分子標誌建立，可有效應用於農林漁牧等相關產業。

• RAD-seq 是結合了限制酶處理和高通量定序優勢的簡化基因體學技術，用於檢測與分析基因體間的遺傳變異。
• 以限制酶切位和片段長度為篩選條件，使 RAD-seq 無需對整個基因體進行定序，降低定序深度需求，同時提高樣品間相似片段的有效序列定序比例。
• RAD-seq 具有多樣品混合定序的特性，使用 DNA 標籤技術（DNA barcoding），可同時研究大量樣本，快速處理個體/族群間的基因體變異，獲得 SNPs 資訊。
• 技術廣泛應用於研究自然種群中的遺傳多樣性、物種分化、突變和進化，以及全基因關聯分析（GWAS）和數量性狀基因座定位（QTL mapping）等研究領域。

• Digestion & Ligation:
• 利用限制酶將 DNA 切割為較小的片段，針對其切位將 DNA 片段標記上特定標籤序列，每個樣本都有唯一的標記序列，用以區分來自不同樣本的片段。
• Pooling:
• 將來自不同樣本的 DNA 片段混合在一起，形成 DNA 樣品庫。
• Size Selection:
• 經由 Size Selection 保留適合上機定序的片段長度，同時去除過短的片段。
• PCR:
• 使用 PCR 反應增殖 DNA 片段，同時完成 DNA 樣品庫的製備，準備進行 NovaSeq 高通量定序。
• Sequencing:
• 完成定序後，對序列進行比對、組裝和分析，獲取樣本中基因體變異的資訊，得到 SNPs 資訊。
  
  

您只需要提供DNA樣品，即可享有樣品建庫、定序，以及生物資訊組裝服務。組裝後的數據可直接供後續各項分析使用，免除研究人員實驗前置作業、數據組裝與處理格式問題所耗時間及設備成本。

艾達特提供 RAD-seq 組裝後的衍生分析，可輸出符合指定期刊格式之科學圖表。依照需求客製化製圖，強調分析成果亮點，並提供兩次修改與重分析服務，確保分析內容符合研究探討主軸，可提供親緣關係樹分析（Phylogenetic Tree）、族群遺傳結構分析（Population genetic structure）、主成分分析（PCA/DAPC）等，除上列進階分析項目，我們也提供客製化分析服務，可依照您提供的參考文獻進行分析評估，如基因隔離地圖（Dispersal map of resistance）、遺傳分化係數分析（Fixation index analysis）、全基因組關聯分析（GWAS）或數量性狀基因座定位（QTL mapping）等。

在您決定使用艾達特的服務之前，您可以聯繫我們，讓我們為您進行 RAD-seq 的基礎介紹以及研究、應用方向的討論，確保艾達特提供的服務能契合您的期望，同時提供給您樣品測試的服務，透過少量的樣品進行酵素適用性測試，確認您的目標樣品所適合的製備方式。